Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN1P18031 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms