Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms