Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms