Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms