Protein–RNA interactions for Protein: P13804

ETFA, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFAP13804 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFAP13804 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFAP13804 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFAP13804 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFAP13804 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFAP13804 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFAP13804 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFAP13804 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFAP13804 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFAP13804 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFAP13804 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFAP13804 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFAP13804 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFAP13804 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFAP13804 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFAP13804 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFAP13804 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFAP13804 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFAP13804 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFAP13804 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFAP13804 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFAP13804 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFAP13804 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFAP13804 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFAP13804 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFAP13804 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFAP13804 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFAP13804 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFAP13804 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFAP13804 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFAP13804 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFAP13804 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFAP13804 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFAP13804 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFAP13804 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFAP13804 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFAP13804 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFAP13804 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFAP13804 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFAP13804 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFAP13804 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFAP13804 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFAP13804 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFAP13804 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFAP13804 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFAP13804 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFAP13804 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFAP13804 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFAP13804 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFAP13804 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFAP13804 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFAP13804 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFAP13804 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFAP13804 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFAP13804 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFAP13804 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFAP13804 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFAP13804 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFAP13804 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFAP13804 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFAP13804 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFAP13804 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFAP13804 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFAP13804 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFAP13804 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFAP13804 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFAP13804 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFAP13804 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFAP13804 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFAP13804 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFAP13804 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFAP13804 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFAP13804 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFAP13804 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFAP13804 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFAP13804 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFAP13804 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ETFAP13804 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ETFAP13804 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFAP13804 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFAP13804 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFAP13804 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFAP13804 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFAP13804 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFAP13804 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFAP13804 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFAP13804 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFAP13804 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFAP13804 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFAP13804 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFAP13804 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFAP13804 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFAP13804 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFAP13804 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFAP13804 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFAP13804 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFAP13804 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFAP13804 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFAP13804 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFAP13804 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms