Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms