Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
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