Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EGFRP00533 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EGFRP00533 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EGFRP00533 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EGFRP00533 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EGFRP00533 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EGFRP00533 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EGFRP00533 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EGFRP00533 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EGFRP00533 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EGFRP00533 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EGFRP00533 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EGFRP00533 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EGFRP00533 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EGFRP00533 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EGFRP00533 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EGFRP00533 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EGFRP00533 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EGFRP00533 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EGFRP00533 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EGFRP00533 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EGFRP00533 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EGFRP00533 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EGFRP00533 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EGFRP00533 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EGFRP00533 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EGFRP00533 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EGFRP00533 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EGFRP00533 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EGFRP00533 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EGFRP00533 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EGFRP00533 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EGFRP00533 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EGFRP00533 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EGFRP00533 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EGFRP00533 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EGFRP00533 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EGFRP00533 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EGFRP00533 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EGFRP00533 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EGFRP00533 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EGFRP00533 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EGFRP00533 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EGFRP00533 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EGFRP00533 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EGFRP00533 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGFRP00533 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGFRP00533 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGFRP00533 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGFRP00533 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGFRP00533 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGFRP00533 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGFRP00533 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGFRP00533 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGFRP00533 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGFRP00533 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGFRP00533 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGFRP00533 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EGFRP00533 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGFRP00533 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EGFRP00533 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGFRP00533 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGFRP00533 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGFRP00533 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EGFRP00533 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGFRP00533 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGFRP00533 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGFRP00533 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGFRP00533 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGFRP00533 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGFRP00533 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EGFRP00533 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EGFRP00533 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EGFRP00533 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EGFRP00533 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EGFRP00533 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EGFRP00533 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EGFRP00533 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EGFRP00533 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EGFRP00533 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EGFRP00533 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EGFRP00533 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EGFRP00533 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EGFRP00533 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EGFRP00533 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EGFRP00533 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EGFRP00533 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EGFRP00533 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EGFRP00533 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EGFRP00533 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EGFRP00533 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EGFRP00533 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EGFRP00533 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EGFRP00533 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EGFRP00533 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EGFRP00533 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGFRP00533 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGFRP00533 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGFRP00533 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGFRP00533 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms