Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms