Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MATN4O95460 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MATN4O95460 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MATN4O95460 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MATN4O95460 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MATN4O95460 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MATN4O95460 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MATN4O95460 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MATN4O95460 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MATN4O95460 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MATN4O95460 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MATN4O95460 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MATN4O95460 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MATN4O95460 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MATN4O95460 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MATN4O95460 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MATN4O95460 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MATN4O95460 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MATN4O95460 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MATN4O95460 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MATN4O95460 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MATN4O95460 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MATN4O95460 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MATN4O95460 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MATN4O95460 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MATN4O95460 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MATN4O95460 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MATN4O95460 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MATN4O95460 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MATN4O95460 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MATN4O95460 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MATN4O95460 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MATN4O95460 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MATN4O95460 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MATN4O95460 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MATN4O95460 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MATN4O95460 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MATN4O95460 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MATN4O95460 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MATN4O95460 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MATN4O95460 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MATN4O95460 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MATN4O95460 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MATN4O95460 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MATN4O95460 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MATN4O95460 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MATN4O95460 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MATN4O95460 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MATN4O95460 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
MATN4O95460 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MATN4O95460 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MATN4O95460 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MATN4O95460 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MATN4O95460 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MATN4O95460 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MATN4O95460 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MATN4O95460 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MATN4O95460 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MATN4O95460 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MATN4O95460 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MATN4O95460 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MATN4O95460 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MATN4O95460 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms