Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMUO75648 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMUO75648 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMUO75648 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMUO75648 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMUO75648 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMUO75648 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMUO75648 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMUO75648 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMUO75648 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMUO75648 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMUO75648 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMUO75648 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMUO75648 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMUO75648 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMUO75648 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMUO75648 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMUO75648 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMUO75648 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMUO75648 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMUO75648 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMUO75648 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMUO75648 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMUO75648 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMUO75648 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMUO75648 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMUO75648 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMUO75648 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMUO75648 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMUO75648 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMUO75648 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMUO75648 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMUO75648 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMUO75648 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMUO75648 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMUO75648 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMUO75648 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMUO75648 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMUO75648 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMUO75648 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMUO75648 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMUO75648 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMUO75648 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMUO75648 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMUO75648 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMUO75648 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMUO75648 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMUO75648 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms