Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSVO60911 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSVO60911 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSVO60911 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSVO60911 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSVO60911 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSVO60911 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSVO60911 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSVO60911 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSVO60911 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSVO60911 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSVO60911 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSVO60911 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSVO60911 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSVO60911 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSVO60911 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSVO60911 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSVO60911 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSVO60911 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSVO60911 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSVO60911 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSVO60911 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSVO60911 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSVO60911 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSVO60911 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSVO60911 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSVO60911 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSVO60911 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSVO60911 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSVO60911 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSVO60911 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSVO60911 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSVO60911 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSVO60911 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSVO60911 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSVO60911 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSVO60911 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSVO60911 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSVO60911 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSVO60911 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSVO60911 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSVO60911 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSVO60911 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSVO60911 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSVO60911 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSVO60911 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSVO60911 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSVO60911 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSVO60911 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSVO60911 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSVO60911 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSVO60911 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSVO60911 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSVO60911 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSVO60911 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSVO60911 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSVO60911 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSVO60911 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSVO60911 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSVO60911 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSVO60911 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSVO60911 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSVO60911 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSVO60911 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSVO60911 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSVO60911 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSVO60911 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSVO60911 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSVO60911 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSVO60911 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSVO60911 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSVO60911 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSVO60911 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSVO60911 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSVO60911 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSVO60911 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSVO60911 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSVO60911 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSVO60911 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSVO60911 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSVO60911 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSVO60911 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSVO60911 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSVO60911 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSVO60911 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSVO60911 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSVO60911 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSVO60911 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSVO60911 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSVO60911 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSVO60911 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSVO60911 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSVO60911 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSVO60911 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSVO60911 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSVO60911 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSVO60911 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSVO60911 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSVO60911 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSVO60911 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms