Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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