Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms