Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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HOXA3O43365 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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HOXA3O43365 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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HOXA3O43365 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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HOXA3O43365 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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HOXA3O43365 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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HOXA3O43365 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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HOXA3O43365 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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