Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APAF1O14727 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APAF1O14727 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APAF1O14727 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APAF1O14727 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APAF1O14727 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APAF1O14727 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APAF1O14727 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APAF1O14727 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APAF1O14727 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APAF1O14727 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APAF1O14727 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APAF1O14727 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APAF1O14727 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APAF1O14727 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APAF1O14727 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APAF1O14727 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APAF1O14727 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APAF1O14727 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
APAF1O14727 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APAF1O14727 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APAF1O14727 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
APAF1O14727 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
APAF1O14727 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APAF1O14727 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APAF1O14727 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APAF1O14727 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
APAF1O14727 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APAF1O14727 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APAF1O14727 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APAF1O14727 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APAF1O14727 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APAF1O14727 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APAF1O14727 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APAF1O14727 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APAF1O14727 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APAF1O14727 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APAF1O14727 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APAF1O14727 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APAF1O14727 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APAF1O14727 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APAF1O14727 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APAF1O14727 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APAF1O14727 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APAF1O14727 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APAF1O14727 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APAF1O14727 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APAF1O14727 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APAF1O14727 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APAF1O14727 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APAF1O14727 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APAF1O14727 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
APAF1O14727 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APAF1O14727 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APAF1O14727 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APAF1O14727 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
APAF1O14727 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APAF1O14727 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APAF1O14727 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APAF1O14727 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APAF1O14727 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APAF1O14727 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APAF1O14727 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APAF1O14727 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APAF1O14727 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APAF1O14727 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APAF1O14727 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APAF1O14727 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APAF1O14727 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APAF1O14727 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APAF1O14727 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APAF1O14727 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APAF1O14727 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APAF1O14727 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APAF1O14727 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APAF1O14727 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APAF1O14727 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
APAF1O14727 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APAF1O14727 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APAF1O14727 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
APAF1O14727 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APAF1O14727 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APAF1O14727 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APAF1O14727 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APAF1O14727 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APAF1O14727 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APAF1O14727 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APAF1O14727 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APAF1O14727 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APAF1O14727 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APAF1O14727 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APAF1O14727 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APAF1O14727 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APAF1O14727 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APAF1O14727 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APAF1O14727 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
APAF1O14727 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APAF1O14727 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APAF1O14727 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APAF1O14727 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms