Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
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