Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms