Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HIP1O00291 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIP1O00291 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIP1O00291 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIP1O00291 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIP1O00291 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIP1O00291 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIP1O00291 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIP1O00291 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIP1O00291 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HIP1O00291 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIP1O00291 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIP1O00291 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIP1O00291 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIP1O00291 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIP1O00291 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIP1O00291 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIP1O00291 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HIP1O00291 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIP1O00291 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIP1O00291 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIP1O00291 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HIP1O00291 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HIP1O00291 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HIP1O00291 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HIP1O00291 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HIP1O00291 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HIP1O00291 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIP1O00291 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIP1O00291 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIP1O00291 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIP1O00291 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIP1O00291 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIP1O00291 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIP1O00291 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HIP1O00291 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIP1O00291 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIP1O00291 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIP1O00291 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIP1O00291 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIP1O00291 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIP1O00291 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIP1O00291 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIP1O00291 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIP1O00291 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIP1O00291 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIP1O00291 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIP1O00291 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HIP1O00291 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIP1O00291 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIP1O00291 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIP1O00291 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIP1O00291 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIP1O00291 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIP1O00291 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HIP1O00291 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIP1O00291 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIP1O00291 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HIP1O00291 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HIP1O00291 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIP1O00291 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIP1O00291 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HIP1O00291 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HIP1O00291 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIP1O00291 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
HIP1O00291 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HIP1O00291 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIP1O00291 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HIP1O00291 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HIP1O00291 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIP1O00291 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HIP1O00291 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIP1O00291 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIP1O00291 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIP1O00291 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HIP1O00291 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIP1O00291 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HIP1O00291 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HIP1O00291 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HIP1O00291 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HIP1O00291 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HIP1O00291 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIP1O00291 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIP1O00291 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIP1O00291 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIP1O00291 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIP1O00291 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIP1O00291 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIP1O00291 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HIP1O00291 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIP1O00291 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIP1O00291 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIP1O00291 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HIP1O00291 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIP1O00291 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIP1O00291 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIP1O00291 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIP1O00291 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIP1O00291 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIP1O00291 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms