Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms