Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
E9PBE3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E9PBE3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E9PBE3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E9PBE3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E9PBE3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E9PBE3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E9PBE3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E9PBE3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E9PBE3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E9PBE3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E9PBE3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E9PBE3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E9PBE3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E9PBE3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E9PBE3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E9PBE3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E9PBE3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E9PBE3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E9PBE3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
E9PBE3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E9PBE3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E9PBE3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E9PBE3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
E9PBE3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
E9PBE3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
E9PBE3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E9PBE3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E9PBE3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E9PBE3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
E9PBE3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E9PBE3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E9PBE3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E9PBE3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E9PBE3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E9PBE3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
E9PBE3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E9PBE3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E9PBE3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E9PBE3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E9PBE3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E9PBE3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E9PBE3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E9PBE3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E9PBE3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E9PBE3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E9PBE3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E9PBE3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E9PBE3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E9PBE3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E9PBE3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E9PBE3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E9PBE3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E9PBE3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E9PBE3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E9PBE3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E9PBE3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E9PBE3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E9PBE3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E9PBE3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E9PBE3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E9PBE3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E9PBE3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E9PBE3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E9PBE3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E9PBE3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E9PBE3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E9PBE3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E9PBE3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E9PBE3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E9PBE3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E9PBE3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E9PBE3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E9PBE3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E9PBE3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E9PBE3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
E9PBE3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E9PBE3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E9PBE3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E9PBE3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E9PBE3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E9PBE3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E9PBE3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E9PBE3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E9PBE3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E9PBE3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E9PBE3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E9PBE3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E9PBE3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E9PBE3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E9PBE3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E9PBE3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E9PBE3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E9PBE3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E9PBE3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E9PBE3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E9PBE3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E9PBE3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E9PBE3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E9PBE3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms