Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD2

GOLGA8J, Golgin subfamily A member 8J, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8JA6NMD2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA8JA6NMD2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA8JA6NMD2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA8JA6NMD2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA8JA6NMD2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA8JA6NMD2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA8JA6NMD2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA8JA6NMD2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA8JA6NMD2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA8JA6NMD2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA8JA6NMD2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA8JA6NMD2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
GOLGA8JA6NMD2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA8JA6NMD2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms