Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms