Protein–RNA interactions for Protein: A6NI47

POTEM, Putative POTE ankyrin domain family member M, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEMA6NI47 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POTEMA6NI47 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
POTEMA6NI47 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
POTEMA6NI47 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POTEMA6NI47 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POTEMA6NI47 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POTEMA6NI47 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POTEMA6NI47 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POTEMA6NI47 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POTEMA6NI47 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POTEMA6NI47 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POTEMA6NI47 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POTEMA6NI47 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POTEMA6NI47 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POTEMA6NI47 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POTEMA6NI47 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POTEMA6NI47 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POTEMA6NI47 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POTEMA6NI47 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POTEMA6NI47 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POTEMA6NI47 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POTEMA6NI47 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POTEMA6NI47 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POTEMA6NI47 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
POTEMA6NI47 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POTEMA6NI47 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POTEMA6NI47 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POTEMA6NI47 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POTEMA6NI47 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms