Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMNCA6NCL1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms