Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms