Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms