Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms