Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms