Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms