Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms