Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TUBE1Q9UJT0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms