Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDH10Q9P2E7 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms