Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms