Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms