Protein–RNA interactions for Protein: Q9P000

COMMD9, COMM domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD9Q9P000 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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COMMD9Q9P000 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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COMMD9Q9P000 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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COMMD9Q9P000 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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COMMD9Q9P000 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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COMMD9Q9P000 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD9Q9P000 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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COMMD9Q9P000 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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COMMD9Q9P000 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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