Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms