Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CNTLNQ9NXG0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTLNQ9NXG0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms