Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 AL390039.1-201ENST00000399148 611 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 AL031058.1-201ENST00000561592 888 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L1Q9NU39 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms