Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms