Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms