Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDHB16Q9NRJ7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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