Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms