Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM5Q9NQX1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRDM5Q9NQX1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms