Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCK4

ROBO2, Roundabout homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO2Q9HCK4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms