Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL3Q9H2J4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms