Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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FOXQ1Q9C009 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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FOXQ1Q9C009 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
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FOXQ1Q9C009 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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FOXQ1Q9C009 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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FOXQ1Q9C009 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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