Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms