Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms