Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms